Uno studio di associazione genome-wide (GWAS) per le vene varicose

Le vene varicose sono una malattia relativamente comune nella popolazione generale.¹ A causa dell’intrinseca cronicità della progressione di questa malattia, essa viene facilmente trascurata e considerata come una patologia non importante.¹ Tuttavia, i sintomi e il disagio che provoca influiscono pesantemente sulla qualità della vita dei pazienti.¹
Nonostante l'elevata prevalenza della patologia, i meccanismi sottostanti rimangono controversi.¹ Ad oggi, si ritiene che il cambiamento strutturale iniziale causato dalla malattia sia il rimodellamento della dilatazione della parete delle vene o l'incompetenza della valvola delle vene.¹ Il meccanismo alla base di queste manifestazioni resta però sconosciuto.¹

Pertanto, per chiarire le complesse basi molecolari che guidano la malattia, un approccio genetico può essere una buona scelta per fornire informazioni pertinenti e guidare future linee di ricerca.¹ Inoltre, la letteratura scientifica indica che un approccio basato su uno studio di associazione genome-wide (GWAS) sia più adatto rispetto ad altri metodi genetici.¹ Una strategia GWAS applicata alle vene può aiutare a identificare i geni implicati nello sviluppo delle vene varicose e rivelare il coinvolgimento di nuove vie metaboliche critiche, traducendo i risultati in una migliore prevenzione e cura della malattia.¹

Su queste basi, lo scopo dello studio di Lee e colleghi del 2022 era di confrontare le informazioni genetiche dei pazienti con vene varicose con quelle di una popolazione sana, cercando di identificare associazioni genetiche significative.¹

Sono stati inclusi 39 pazienti con classificazioni CEAP (Clinical-Etiology-Anatomy-Pathophysiology) C2-C3 e 57 pazienti con classificazioni C4, C5 e C6.¹
Dopo il confronto delle informazioni genetiche di 96 pazienti con vene varicose con le informazioni genetiche dei rispettivi controlli sani, sono stati identificati 2 polimorfismi a singolo nucleotide significativi (SNP, single-nucleotide polymorphism).¹ Uno era localizzato nel gene DPYSL2 e l'altro nel gene VSTM2L.¹ Un ulteriore confronto tra il sottogruppo di pazienti C2-3 e il sottogruppo C4-6 ha identificato altri 4 SNP significativi, che si trovavano nei geni ZNF664-FAM101A, PHF2, ACOT11 e TOM1L1.¹

Tra questi 6 SNP identificati nello studio, i 3 localizzati nei geni PHF2, ACOT11 e TOM1L1 erano probabilmente correlati allo sviluppo della malattia in base alle funzioni delle proteine associate.¹ Le malattie associate al gene PHF2, ad esempio, includono ulcere da decubito e ulcere croniche della cute.¹ Clinicamente, i pazienti con grave malattia delle vene varicose tendono a sviluppare iperpigmentazione della pelle, specialmente nella regione mediale delle caviglie.¹ Se non trattata, l'area iperpigmentata della cute tende ad assottigliarsi e ne consegue la formazione di ulcere.¹ Le malattie associate al gene ACOT11 includono invece la sindrome di Loeys-Dietz e la linfoadenite suppurativa.¹ La sindrome di Loeys-Dietz è una malattia ereditaria che coinvolge un disturbo del tessuto connettivo che predispone i pazienti allo sviluppo di aneurismi aortici e altre patologie vascolari.¹ Le vene varicose sono una malattia caratterizzata da una scarsa costruzione del tessuto connettivo e gli aneurismi venosi tendono a svilupparsi con il progredire della malattia.¹ In conclusione, questo studio illustra il primo GWAS applicato al sistema venoso ed eseguito in una popolazione taiwanese.¹ Tutti e 6 gli SNP identificati e i geni corrispondenti riportati in questo studio sono degni di ulteriori indagini.¹

Che cos’è uno studio di associazione genome-wide (GWAS)?
Uno studio di associazione genome-wide (GWAS) è un approccio di ricerca utilizzato per identificare le varianti genomiche che si associano, statisticamente, al rischio di comparsa di una patologia o di un tratto particolare.² Il metodo prevede l’analisi dei genomi di molte persone, alla ricerca di varianti genomiche che si verificano più frequentemente nelle persone con una malattia o con un tratto specifico, rispetto alle persone che non presentano quella malattia o quel tratto.¹ Una volta identificate, tali varianti genomiche vengono, in genere, utilizzate per individuare varianti prossime che contribuiscono direttamente alla malattia o al tratto.²

Bibliografia
1. Lee M-L et al. Phlebology. 2022 May;37(4):267-278.
2. Hutter C.M. Ph.D. GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDIES (GWAS) (aggiornato il 01/07/2022).
https://www.genome.gov/genetics-glossary/Genome-Wide-Association-Studies